Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcxO88809 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DcxO88809 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DcxO88809 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DcxO88809 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DcxO88809 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DcxO88809 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DcxO88809 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DcxO88809 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DcxO88809 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DcxO88809 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcxO88809 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcxO88809 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcxO88809 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcxO88809 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DcxO88809 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DcxO88809 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DcxO88809 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DcxO88809 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DcxO88809 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DcxO88809 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DcxO88809 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DcxO88809 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DcxO88809 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DcxO88809 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DcxO88809 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DcxO88809 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DcxO88809 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DcxO88809 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DcxO88809 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DcxO88809 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DcxO88809 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DcxO88809 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DcxO88809 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcxO88809 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DcxO88809 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DcxO88809 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DcxO88809 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DcxO88809 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DcxO88809 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DcxO88809 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DcxO88809 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DcxO88809 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcxO88809 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcxO88809 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcxO88809 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DcxO88809 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms