Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE8AO60658 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE8AO60658 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE8AO60658 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE8AO60658 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms