Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD6O60522 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD6O60522 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD6O60522 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD6O60522 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD6O60522 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD6O60522 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD6O60522 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD6O60522 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD6O60522 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD6O60522 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms