Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l1O54818 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms