Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkaO54804 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkaO54804 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkaO54804 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkaO54804 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkaO54804 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkaO54804 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChkaO54804 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChkaO54804 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChkaO54804 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms