Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITM2AO43736 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms