Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIPA1L1O43166 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIPA1L1O43166 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SIPA1L1O43166 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms