Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1baO35930 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1baO35930 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms