Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TnxbO35452 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TnxbO35452 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TnxbO35452 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnxbO35452 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnxbO35452 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TnxbO35452 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TnxbO35452 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TnxbO35452 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms