Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CrcpO35427 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CrcpO35427 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CrcpO35427 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CrcpO35427 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CrcpO35427 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CrcpO35427 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CrcpO35427 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CrcpO35427 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CrcpO35427 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms