Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf5O35326 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf5O35326 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf5O35326 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf5O35326 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms