Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmafO35242 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmafO35242 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmafO35242 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmafO35242 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmafO35242 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmafO35242 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NsmafO35242 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms