Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC27A2O14975 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC27A2O14975 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A2O14975 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A2O14975 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A2O14975 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A2O14975 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC27A2O14975 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC27A2O14975 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A2O14975 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A2O14975 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SLC27A2O14975 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A2O14975 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A2O14975 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A2O14975 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A2O14975 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms