Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltbp2O08999 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltbp2O08999 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltbp2O08999 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms