Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Barx2O08686 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Barx2O08686 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barx2O08686 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barx2O08686 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Barx2O08686 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Barx2O08686 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Barx2O08686 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Barx2O08686 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Barx2O08686 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms