Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Myh11O08638 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Myh11O08638 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myh11O08638 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myh11O08638 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myh11O08638 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh11O08638 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh11O08638 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh11O08638 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh11O08638 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms