Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM38O00635 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM38O00635 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms