Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC024978J3QPC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC024978J3QPC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC024978J3QPC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms