Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21900J3QP38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm21900J3QP38 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm21900J3QP38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm21900J3QP38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm21900J3QP38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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