Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc180J3QNE4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc180J3QNE4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc180J3QNE4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms