Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28051J3QMA2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28051J3QMA2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms