Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20825J3QM67 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20825J3QM67 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20825J3QM67 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20825J3QM67 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20825J3QM67 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20825J3QM67 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20825J3QM67 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20825J3QM67 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms