Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930544D05RikJ3QK56 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930544D05RikJ3QK56 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms