Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arfgef1G3X9K3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arfgef1G3X9K3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms