Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BicraF8VPZ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
BicraF8VPZ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
BicraF8VPZ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
BicraF8VPZ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms