Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp9yF8VPU6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp9yF8VPU6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9yF8VPU6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Usp9yF8VPU6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp9yF8VPU6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp9yF8VPU6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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