Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt90E9Q1Z0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms