Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PROB1E7EW31 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms