Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2W7

Cyp3a59, Cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 59, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a59D3Z2W7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp3a59D3Z2W7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp3a59D3Z2W7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp3a59D3Z2W7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp3a59D3Z2W7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp3a59D3Z2W7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp3a59D3Z2W7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms