Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc13D3YV10 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms