Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERVV-2B6SEH9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVV-2B6SEH9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms