Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp42B2RQC2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp42B2RQC2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms