Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scn7aB1AYL1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn7aB1AYL1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms