Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfx1B1AY10 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfx1B1AY10 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms