Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EFCAB5A4FU69 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
EFCAB5A4FU69 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
EFCAB5A4FU69 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms