Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm6880A3KG45 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6880A3KG45 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm6880A3KG45 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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