Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms