Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prdm2A2A7B5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prdm2A2A7B5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms