Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms