Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms