Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC61Q9Y6R9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC61Q9Y6R9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC61Q9Y6R9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms