Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYVE1Q9Y5Y7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1301.9 ms