Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPSEQ9Y251 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms