Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nme3Q9WV85 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms