Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec2Q9WV35 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec2Q9WV35 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms