Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabbr1Q9WV18 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabbr1Q9WV18 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms