Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms