Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sema6cQ9WTM3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sema6cQ9WTM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms