Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4AQ9UM21 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4AQ9UM21 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4AQ9UM21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4AQ9UM21 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4AQ9UM21 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4AQ9UM21 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4AQ9UM21 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4AQ9UM21 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms