Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4Q9UKN8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4Q9UKN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms